Хирургическое отделение основано в июле 1995 года. Основной контингент больных был представлен военнослужащими срочной службы с гнойными инфекциями кожи.     

         В отделении проводится лечение пациентов общехирургического профиля, травматологических, урологических, гинекологических и больных с раневой инфекцией. Выполняются лечебные процедуры на аппарате «Светило», цистоскопия, уретроскопия, кольпоскопия. В среднем за год производится более четырёхсот оперативных вмешательств в плановом и экстренном порядке. На базе отделения проводится экспертиза водолазов и плавсостава.