Хирургическое отделение (специализированное) существует со дня образования госпиталя, долгое время его возглавлял подполковник медицинской службы Покаленьев Сергей Владимирович. Затем его сменил подполковник медицинской службы Хиврич Виталий Юрьевич. Длительное время исполняли обязанности начальника отделения майор медицинской службы Усатов Константин Владимирович, майор медицинской службы Ткаченко Вячеслав Владимирович.
В отделении организовано оказание специализированной медицинской помощи по профилям: стоматологическому, оториноларингологическому, офтальмологическому, осуществляется зубопротезирование.